Bluetoothスタックのバージョンは最新版の4.20.08ですが、以前のバージョンでは問題なかったので戻してみたりしましたが特に効果無し。
マイク設定がミュートになっていないかなども確認しましたが、特に異常は見られず…

X505/SPもUX90PSも同様にダメなので、とりあえずコントロールパネルから「サウンドとオーディオデバイス」を開いてヘッドセットの動作テストを行うと、こちらからはマイクがちゃんと音を拾ってます。
やはりハードに異常は無いということで、もう一度skypeテストを行ってみると今度はちゃんとマイクが動作してます。
何故かOS側で一度動作テストを行うとその後はskypeでも正常動作するようですorz
最初にペアリングするために接続したときにはこんなこと無かったんですけどね…
X505/SPもUX90PSもこの方法で問題なく動作しました。

うぅ…こんなことで一週間も悩んだのかorz